原核生物的启动子有哪些基本特征

Question

原核生物的启动子有哪些基本特征

Answer 1

启动子：RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必需的一段DNA序列.
不同的启动子都存在保守的共同序列,包括RNA聚合酶识别位点和结合位点.
（1）、-10序列在转录起点上游大约-10处,有一个6bp的保守序列TATAAT,称Pribnow框.此段序列出现在-4到-13bp之间,每个位点的保守性在45%-100%.
频度：T89 A89 T50 A65 A65 T100
据预测,Pribnow框中,一开始的TA和第6位最保守的T在结合RNA聚合酶时起十分重要的作用.
目前认为,Pribnow框决定转录方向.酶在此部位与DNA结合形成稳定的复合物,Pribnow框中DNA序列在转录方向上解开,形成开放型起始结构,它是RNA聚合酶牢固的结合位点,是启动子的关键部位.
RNA聚合酶的结合,诱导富含AT的Pribnow框的双链解开,然后进一步扩大成17个核苷酸长度的泡状物,在泡状物中RNA聚合酶从模板链开始转录RNA产物.
（2）、-35序列
只含-10序列的DNA不能转录,在-10序列上游还有一个保守序列,其中心约在-35位置,称为-35序列,此序列为RNA酶的识别区域.
各碱基出现频率如下：T85 T83 G81 A61 C69 A52 ,其中TTG十分保守.
-35序列的功能：它是原核RNA聚合酶全酶依靠σ因子的初始识别位点.因此,-35序列对RNA聚合酶全酶有很高的亲和性.-35序列的核苷酸结构,在很大程度上决定了启动子的强度,RNA聚合酶易识别强的启动子.
-35序列提供RNA聚合酶识别信号,
-10序列有助于DNA局部双链解开,启动子结构的不对称性决定了转录的方向.