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想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢希望各位能给与详细指导,谢谢大家

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想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢
希望各位能给与详细指导,谢谢大家
▼优质解答
答案和解析
找近缘种,越近越好,的那个基因 都下下来
ncbi或软件都可以比对,找高度保守区

具体操作为,蛋白序列和DNA序列都下,从连着7-8个蛋白保守区处比着DNA设计引物, 如果有四个是G,两个是A就选G, 要是一半一半就设计简并引物.
一个引物简并引物不能超过3个!
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