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用CTAB法提取老玉米叶DNA,OD260/OD280值正常,但OD260/OD230值总是小于2.0,最好的也不过1.8。怎么解决?试过沉淀后用乙醇多洗几遍,但是没什么效果。在用这些DNA做指纹图谱的时候总是有一些
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用CTAB法提取老玉米叶DNA,OD260/OD280值正常,但OD260/OD230值总是小于2.0,最好的也不过1.8。怎么解决?试过沉淀后用乙醇多洗几遍,但是没什么效果。在用这些DNA做指纹图谱的时候总是有一些标记出不来。(能出来的标记始终能出来,开始没出来的反复做最终也只出来几个,还是有4个左右出不来)现在已经排除了是反应体系或是PCR过程或是电泳过程的问题。
▼优质解答
答案和解析
先说下吸光度和比值的意义。 A280nm 是蛋白和酚类物质最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA的A260/A280比值为1.8,纯RNA为2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化样品。比值=1.5相当于50%蛋白质/DNA溶液; A230nm 是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA和 RNA的A260/A230比值为2.5。若比值小于2.0标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。A230产生负值主要是由于在很低DNA 浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀释度,A230的负值会被校正。 A260/A280和A260/A230 是核酸纯度的指示值,纯度好的DNA,在pH7-8.5 下其比值应该在2.0 或2.5,A260 / A280的比值, 用于评估样品的纯度, 因为蛋白的吸收峰是280 nm。 纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。 A230是多肽、芳香基团、苯酚和一些碳氢化合物的吸光度,A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、多肽、苯酚等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0 。A280是蛋白质的吸光度。 我的建议:将所提取的DNA跑琼脂糖凝胶电泳,然后回收纯化一下。 另提供一种CTAB改进法配方: 组份Tris-HCl (pH8.0) EDTA (pH8.0) NaCl CTAB PVP40 β-巯基乙醇 终浓度 100 mM 20 mM 1.4M 3%(W/V) 5%(W/V) 2%(V/V)使用前加入 PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。 希望对你有所帮助!
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