kozak序列,基因,atg后现不是g,如何

Question

kozak序列,基因,atg后现不是g,如何

Answer 1

Kozak序列是位于真核生物mRNA 5’端帽子结构后面的一段核酸序列,通常是ACCACCATGG,它可以与翻译起始因子结合而介导含有5’帽子结构的mRNA翻译起始.对应于原核生物的SD序列.
人类起始密码子周围的序列
kozak序列：Kozak consensus sequence,Kozak consensusor Kozak sequence
存在于真核生物mRNA的一段序列,其在翻译的起始中有重要作用.
核糖体能够识别mRNA上的这段序列,并把它作为翻译起始位点.注意这段序列并不是ribosomal binding site (RBS)核糖体结合位点,而是帽子结构.
真核生物基因中起始密码子上下游的最佳序列为,-3位为嘌呤碱基；+4位为G,起始密码子AUG中的A处于+1位.A/GCCAUGG被称为kozak序列或扫描序列.
KOZAK是一个女科学家,她研究过起始密码子AUG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子两端序列为：—— G/N-C/N-C/N-ANNAUGG——,如GCCACCAUGG、GCCAUGAUGG时,转录和翻译效率最高,特别是-3位的A对翻译效率非常重要.该序列被后人称为Kozak序列,并被应用于表达载体的构建中.
所谓Kozak规则,即第一个AUG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律,若将第一个AUG中的碱基A,U,G分别标为1,2,3位,则Kozak规则可描述如下：
(1)第4位的偏好碱基为G；
(2)AUG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T；
(3)在-3,-6和-9位置,G是偏好碱基；
(4)除-3,-6和-9位,在整个侧翼序列区,C是偏好碱基.
Kozak规则是基于已知数据的统计结果,不见得必须全部满足,一般来说,满足前两项即可.
真核引物设计需在AUG前加上GCCACC
不论全长还是部分,在做真核表达时,一般都要带上kozak序列,用部分cDNA时,还要加上AUG.多加一些上游序列对你有利,因为一些上游序列自带KOZAK序列；或其他促进表达的序列..有利于引物设计,因为从AUG开始设计引物,不是每个基因都可以的.引物扩增时头几个容易错,在上游序序列就没关系了.
加Kozark sequence(GCCACC)是用来增强真核基因的翻译效率的.是最优化的AUG环境,避免ribosome（核糖体）出现leaky scan